杭州個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法

代謝組學(xué)的研究對(duì)象與層次有哪些？一般來(lái)說(shuō)，代謝組學(xué)關(guān)注的對(duì)象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據(jù)研究的對(duì)象和目的不同，科學(xué)家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個(gè)層次：代謝物靶標(biāo)分析：某一個(gè)或幾個(gè)特定組分的定性和定量分析，如某一類結(jié)構(gòu)、性質(zhì)相關(guān)的化合物（氨基酸、有機(jī)酸、順二醇類）或者某一代謝途徑的所有中間產(chǎn)物或多條代謝途徑的標(biāo)志性組分。代謝物指紋分析：同時(shí)對(duì)多個(gè)代謝物進(jìn)行分析，不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析：限定條件下對(duì)生物體內(nèi)特定組織內(nèi)的代謝產(chǎn)物的快速定性和半定量分析。代謝組分析：對(duì)生物體或體內(nèi)某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析，并研究該代謝物組在外界干預(yù)或病理生理?xiàng)l件下的動(dòng)態(tài)變化規(guī)律。代謝組學(xué)關(guān)注的對(duì)象是分子量在1000以下的小分子化合物。杭州個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法

代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用：與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比，代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性，是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性、特性和規(guī)律，目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn)。盡管充滿了挑戰(zhàn)，研究人員仍然堅(jiān)信，與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比，代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。疾病導(dǎo)致機(jī)體病理生理過(guò)程變化，引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變，通過(guò)對(duì)某些代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析，并與正常人的代謝產(chǎn)物比較，尋找疾病的生物標(biāo)記物，將提供一種較好的疾病診斷方法。杭州個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是質(zhì)譜（MS）。

代謝組學(xué)比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法：代謝組學(xué)分析數(shù)據(jù)用于統(tǒng)計(jì)分析時(shí)，數(shù)據(jù)集通常為一個(gè)N × K的矩陣（X矩陣），N表示N個(gè)樣本數(shù)，每一行表示一個(gè)樣品， K表示K個(gè)變量，每一列表示一個(gè)變量，在代謝組學(xué)中變量通常是指代謝物含量。單變量分析方法只分別分析單個(gè)變量，不考慮多個(gè)變量的相互作用與內(nèi)在聯(lián)系。具有簡(jiǎn)單性、易應(yīng)用性和可解釋性。但是無(wú)法基于整體數(shù)據(jù)對(duì)所測(cè)樣品的優(yōu)劣、差異進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)和分析。差異倍數(shù)變化大?。‵old Change，F(xiàn)C）表示實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組的含量比值，可以快速考察各個(gè)代謝物在不同組別之間的含量變化大小。

代謝組學(xué)什么類型的樣本更適合，樣本采集需要注意什么？絕大多數(shù)可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學(xué)研究。常見的樣本主要有：臨床和動(dòng)物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液；細(xì)胞和微生物、培養(yǎng)液和發(fā)酵液；植物的根、莖、葉、花等。代謝每時(shí)每刻都在發(fā)生變化，我們需要研究的是某個(gè)或多個(gè)瞬時(shí)狀態(tài)，因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡(jiǎn)單”的，采集后通過(guò)低溫淬滅（如液氮淬滅或低溫凍存等）的方法阻止離體后的樣本的代謝活動(dòng)。另外，不同的檢測(cè)要求也需要配合不同的收集方法，具體步驟請(qǐng)參照譜領(lǐng)生物樣本收集步驟文件。代謝組學(xué)在食品安全領(lǐng)域，利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動(dòng)植物體內(nèi)的相關(guān)生物標(biāo)志物也是一個(gè)熱點(diǎn)領(lǐng)域。

藥物代謝和代謝組學(xué)區(qū)別：代謝組學(xué)與藥物代謝不同是它關(guān)注的對(duì)象不是外源性的藥物而是生物體本身就有的內(nèi)源性代謝物。這些代謝物是糖，脂肪，蛋白質(zhì)，核酸，膽汁酸等等代謝得到的。還有共生菌代謝的，是一個(gè)龐大的混合物。目的是通過(guò)樣本的對(duì)比，發(fā)現(xiàn)潛在標(biāo)志物，指導(dǎo)疾病早期診斷甚至基因水平的研究。而藥物代謝的目標(biāo)是只要只要追蹤到這種藥物分子在體內(nèi)變化就好，相當(dāng)具有靶向性，因此使用的技術(shù)手段就是LC-MS。檢測(cè)藥物的中間體，和具體的藥效，藥代動(dòng)的效應(yīng)。LC-MS非靶向代謝組的優(yōu)勢(shì)有什么？杭州個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法

代謝組學(xué)是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分。杭州個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法

LC-MS非靶向代謝組學(xué)：LC-MS非靶向代謝組學(xué)通過(guò)液質(zhì)聯(lián)用（LC-MS）方法檢測(cè)生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動(dòng)態(tài)變化，重點(diǎn)尋找在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中有明顯變化的代謝物，進(jìn)而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系，其研究對(duì)象大都是分子量1500Da以內(nèi)的小分子物質(zhì)。LC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢(shì)：1、較高的靈敏度、分辨率；2、較寬的動(dòng)態(tài)范圍；3、適合于生物樣本中復(fù)雜代謝產(chǎn)物的檢測(cè)和潛在標(biāo)志物的鑒定；4、適合對(duì)標(biāo)本中未知代謝物的探索研究。杭州個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法