江蘇植物靶向代謝組學(xué)方法

代謝組學(xué)發(fā)展前景：代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)后出現(xiàn)的新興“組學(xué)”,每年發(fā)表的代謝組學(xué)研究的文章數(shù)量都在不斷增加。代謝組學(xué)的發(fā)展很迅速，盡管還沒(méi)有經(jīng)典論文出現(xiàn),但是研究人員相信，與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比，代謝組學(xué)將在臨床上發(fā)揮更大的作用。許多公司通過(guò)市場(chǎng)研究發(fā)現(xiàn)，健康人并不希望進(jìn)行基因型分析，所以，對(duì)于這些人群來(lái)說(shuō)，基因組學(xué)研究在臨床上的應(yīng)用很有限。而代謝組學(xué)與臨床化學(xué)較為相似，且相對(duì)于基因組學(xué)來(lái)說(shuō)，提供的個(gè)人信息更少，故其在臨床上的應(yīng)用有可能產(chǎn)生一定的影響。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比，代謝組學(xué)將在臨床上發(fā)揮更大的作用。江蘇植物靶向代謝組學(xué)方法

代謝組學(xué)如何控制臨床樣本的質(zhì)量？對(duì)于臨床的樣本建議每組比較低的25個(gè)生物學(xué)重復(fù)，達(dá)到30例以上比較好。因?yàn)榕R床樣本受外界環(huán)境和遺傳背景影響較大，需要很多生物學(xué)重復(fù)來(lái)消除這些外在影響。此外，在樣本收集過(guò)程中，應(yīng)保持收養(yǎng)的時(shí)間段和操作程序盡可能一致。代謝組學(xué)樣本收集取樣基本原則：表示性和一致性：驗(yàn)組與對(duì)照組樣本在取材部位、時(shí)間處理等方面盡可能保持一致，從而保證實(shí)驗(yàn)的可信度；迅速性：操作過(guò)程迅速，很大限度縮短樣本采集到實(shí)驗(yàn)的時(shí)間；低溫原則：所有樣本離體后，分離步驟應(yīng)在4℃或冰上進(jìn)行，分離好的樣本立即存于-80℃，以免樣本產(chǎn)生進(jìn)一步代謝活動(dòng)。江蘇植物靶向代謝組學(xué)方法與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比，代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。

GC-MS非靶向代謝組學(xué)能檢測(cè)到哪些類(lèi)別的代謝物？衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測(cè)分析范圍。GC/MS能檢測(cè)到有機(jī)酸、氨基酸、單糖、糖醇、胺類(lèi)、脂肪酸、吲哚、單甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和膽汁酸等代謝物。如何提高定性準(zhǔn)確度？GC/MS的定性有雙重標(biāo)準(zhǔn)，一是保留指數(shù)，二是質(zhì)譜信息的相似度（similarity）。不同于LC/MS的軟電離源，GC/MS使用的EI源屬于硬電離，能量較強(qiáng)且穩(wěn)定，在將代謝物分子電離后，分子離子峰進(jìn)一步碎裂產(chǎn)生豐富的碎片離子。因此，我們很難在GC/MS上看到分子離子峰。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”，將儀器得到的實(shí)際指紋圖譜和質(zhì)譜庫(kù)（如NIST庫(kù)）進(jìn)行比對(duì)后，我們將會(huì)得到一個(gè)叫相似度的指標(biāo)。保留指數(shù)和相似度都必須滿足設(shè)定的閾值，軟件才會(huì)給出色譜峰的定性結(jié)果。然后采用標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)譜信息進(jìn)行完全比對(duì)定性，也就是說(shuō)只有經(jīng)過(guò)標(biāo)準(zhǔn)品比對(duì)，代謝物才是被100%定性。

代謝組學(xué)在系統(tǒng)生物學(xué)中有什么作用？它的地位如何？代謝物作為生物體表型的基礎(chǔ)能夠幫助我們更直觀有效地了解生命現(xiàn)象揭示生命本質(zhì)。代謝組學(xué)本質(zhì)上是指從整體上研究生物體的代謝物，是對(duì)某一生物、組織或細(xì)胞中的所有低分子量代謝產(chǎn)物進(jìn)行定性與定量分析的一門(mén)科學(xué)。代謝組學(xué)以指標(biāo)分析為基礎(chǔ)，高通量檢測(cè)為手段，通過(guò)研究生物體內(nèi)代謝物的種類(lèi)與數(shù)量及其變化規(guī)律來(lái)闡述機(jī)體在正常生命狀態(tài)及環(huán)境變化后的代謝過(guò)程。代謝組是系統(tǒng)生物學(xué)的分支學(xué)科之一。其研究?jī)?nèi)容主要包括對(duì)代謝物進(jìn)行定性或定量分析，不同基因型的生物體進(jìn)行代謝組學(xué)表型研究，不同生長(zhǎng)環(huán)境及加物理、化學(xué)或生物性刺激后個(gè)體代謝產(chǎn)物的應(yīng)答，進(jìn)行代謝途徑或代謝網(wǎng)絡(luò)解析與轉(zhuǎn)基因評(píng)價(jià)。代謝組學(xué)可與生物表型變化建立直接相關(guān)性。

代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些？1、疾病機(jī)制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開(kāi)發(fā)。4、藥物作用機(jī)制的研究。5、藥物毒性評(píng)價(jià)。6、植物的細(xì)胞代謝組學(xué)研究。7、微生物代謝組學(xué)研究。代謝組能夠檢測(cè)到的代謝物含量是多少？不同檢測(cè)平臺(tái)的靈敏度不一樣，靈敏度比較高，可達(dá)到fM級(jí)。另外，相同含量的不同物質(zhì)，由于自身化學(xué)性質(zhì)不同，質(zhì)譜的離子化效率、信號(hào)響應(yīng)強(qiáng)度會(huì)差異很大。物質(zhì)的檢測(cè)靈敏度跟自身的化學(xué)性質(zhì)有關(guān)，化學(xué)性質(zhì)的影響主要表現(xiàn)在離子化效率和質(zhì)譜碎裂行為兩方面。因此，相同含量的不同物質(zhì)，可能一個(gè)能檢測(cè)出來(lái)，另一個(gè)檢測(cè)不出來(lái)。代謝組學(xué)在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。江蘇植物靶向代謝組學(xué)方法

代謝組學(xué)先進(jìn)分析檢測(cè)技術(shù)結(jié)合模式識(shí)別和**系統(tǒng)等計(jì)算分析方法是代謝組學(xué)研究的基本方法。江蘇植物靶向代謝組學(xué)方法

代謝組學(xué)樣本收集植物組織：葉片、莖、花：1）取整片葉片/一段莖/一朵花，放入離心管或錫箔紙中并標(biāo)記，迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2）將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中（每組一袋），在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明樣本信息。3）迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送。注意：（1）采集葉片樣本時(shí)，在中午光照好的時(shí)間收集。（2）采集樣本時(shí)保持樣本一致性，尤其是同一組樣本（顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等）。根：1）取整株植物的根部，迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養(yǎng)基或營(yíng)養(yǎng)液等；2）吸水紙吸干水分后，分裝為500 mg/管；3）標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min，-80 ℃凍存，干冰寄送。江蘇植物靶向代謝組學(xué)方法

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