代謝組學(xué)介紹:通過液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)方法檢測(cè)生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動(dòng)態(tài)變化,重點(diǎn)尋找在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中有明顯變化的代謝物,進(jìn)而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系,其研究對(duì)象大多是分子量1500Da以內(nèi)的小分子物質(zhì)。技術(shù)優(yōu)勢(shì):較高的靈敏度、分辨率;較寬的動(dòng)態(tài)范圍;適合對(duì)標(biāo)本中未知代謝物的探索研究;適合于生物樣本中復(fù)雜代謝產(chǎn)物的檢測(cè)和潛在標(biāo)志物的鑒定。代謝組學(xué)應(yīng)用方向: 土壤代謝組學(xué)。研究土壤中有機(jī)質(zhì)及土壤微生物代謝含量變化及相互作用,了解土壤微生物多樣性及其碳代謝能力,為探索調(diào)節(jié)、控制和改善土壤環(huán)境質(zhì)量提供重要的參考。靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標(biāo)性代謝組學(xué)。貴陽脂質(zhì)代謝組學(xué)多技術(shù)服務(wù)
代謝組學(xué)樣品收集方法及所需樣本量是什么?(1) 血清樣品: 避免反復(fù)凍融。血液收集在離心管中靜置30分鐘進(jìn)行凝血。8000rpm離心10分鐘,取上清分裝到凍存管中,放置液氮中或-80度凍存;單個(gè)樣本要求體積為50μL。(2) 尿液樣品:臨床樣本請(qǐng)全部取清晨第1次尿液。尿液直接分裝到離心管中,8000rpm離心10分鐘,取上清分裝到凍存管中,放置液氮中或-80度凍存,-80度凍存;單個(gè)樣本要求體積為100μL。(3) 其他樣本收集辦法請(qǐng)咨詢譜領(lǐng)工作人員。南京代謝組學(xué)質(zhì)譜鑒定代謝組學(xué)在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。
代謝組學(xué)比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法:代謝組學(xué)分析數(shù)據(jù)用于統(tǒng)計(jì)分析時(shí),數(shù)據(jù)集通常為一個(gè)N × K的矩陣(X矩陣),N表示N個(gè)樣本數(shù),每一行表示一個(gè)樣品, K表示K個(gè)變量,每一列表示一個(gè)變量,在代謝組學(xué)中變量通常是指代謝物含量。單變量分析方法只分別分析單個(gè)變量,不考慮多個(gè)變量的相互作用與內(nèi)在聯(lián)系。具有簡單性、易應(yīng)用性和可解釋性。但是無法基于整體數(shù)據(jù)對(duì)所測(cè)樣品的優(yōu)劣、差異進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)和分析。差異倍數(shù)變化大小(Fold Change,F(xiàn)C)表示實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組的含量比值,可以快速考察各個(gè)代謝物在不同組別之間的含量變化大小。
代謝組學(xué)樣本收集注意事項(xiàng):(1)血液離開動(dòng)物或人體后,應(yīng)盡快開展血清、血漿的分離,并嚴(yán)格按照操作說明進(jìn)行。(2)采集到的血清為黃色透明液體、血漿為淡黃色半透明液體,如果發(fā)現(xiàn)樣本中是紅色,說明在已經(jīng)發(fā)生了了溶血現(xiàn)象,樣本需重新制備。(3)血清與血漿的主要區(qū)別在于血清中不含纖維蛋白原。血清和血漿中脂質(zhì),氨基酸,核苷酸等代謝譜存在差別。糞便樣本收集:1.人糞便:(1)用無菌勺挖取新鮮的,排泄中后部的內(nèi)側(cè)糞便(避免尿液及其他壁對(duì)樣本污染);(2)分裝樣本20mg/管。(3)迅速放入液氮中冷凍處理至少15min.(4)-80℃冰箱凍存。寄樣需足量干冰。代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是色譜(HPLC,GC)。
代謝組學(xué)樣本收集植物組織:果實(shí)、種子:1)對(duì)于含水量高、體積較大的果實(shí)(番茄、西瓜、蘋果等)需要先將樣品分成“均勻”的小塊(≈ 200 mg/樣本)分裝至2 mL離心管中,標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)對(duì)于細(xì)小的顆粒種子(擬南芥種子、谷物種子等),可以先將同一組的植株種子混勻后再分裝(≈ 200 mg/樣本)至離心管中,標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。3)對(duì)于要求對(duì)整個(gè)果實(shí)進(jìn)行提取的(整粒葡萄等),需要把果實(shí)裝在50 mL離心管/自封袋中,標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少15min,-80 ℃凍存,干冰寄送。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律。貴州常規(guī)靶向代謝組學(xué)鑒定
代謝組學(xué)技術(shù)得到了迅速發(fā)展。貴陽脂質(zhì)代謝組學(xué)多技術(shù)服務(wù)
代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比, 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn)。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅(jiān)信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。疾病導(dǎo)致機(jī)體病理生理過程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過對(duì)某些代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析,并與 正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標(biāo)記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。貴陽脂質(zhì)代謝組學(xué)多技術(shù)服務(wù)
上海拜譜生物科技有限公司致力于商務(wù)服務(wù),是一家服務(wù)型公司。拜譜生物致力于為客戶提供良好的多組學(xué)服務(wù),質(zhì)譜檢測(cè),蛋白質(zhì)組學(xué),代謝組學(xué),一切以用戶需求為中心,深受廣大客戶的歡迎。公司將不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力,努力學(xué)習(xí)行業(yè)知識(shí),遵守行業(yè)規(guī)范,植根于商務(wù)服務(wù)行業(yè)的發(fā)展。拜譜生物秉承“客戶為尊、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營理念,全力打造公司的重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力。