靶向代謝組學(xué)的一般分析流程為：1. 數(shù)據(jù)采集 第1步是得到標準品。如果無法從市場上買到，就必須定制合成。然后通過優(yōu)化產(chǎn)物離子碰撞能量以得到的信號，再通過測定三重串聯(lián)四極桿測定代謝物的 MRM 躍遷值。2. 定量 接下來用定量分析軟件對 MRM 數(shù)據(jù)進行處理，得到報告。3. 統(tǒng)計分析和解釋 將定量報告輸入統(tǒng)計分析軟件包，用統(tǒng)計工具，如ANOVA，對數(shù)據(jù)進行處理。靶向分析：在基于質(zhì)譜的代謝組學(xué)分析中，要意識到離子強度和色譜保留時間都會隨著時間的推移而產(chǎn)生漂移，所以在實驗中，要按隨機順序?qū)颖具M行檢測，且數(shù)據(jù)需要在同天同一批次進行采集，以減少誤差。代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是核磁共振。貴州LC-MS／MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析
GC-MS非靶向代謝組學(xué)能檢測到哪些類別的代謝物？衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測分析范圍。GC/MS能檢測到有機酸、氨基酸、單糖、糖醇、胺類、脂肪酸、吲哚、單甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和膽汁酸等代謝物。如何提高定性準確度？GC/MS的定性有雙重標準，一是保留指數(shù)，二是質(zhì)譜信息的相似度（similarity）。不同于LC/MS的軟電離源，GC/MS使用的EI源屬于硬電離，能量較強且穩(wěn)定，在將代謝物分子電離后，分子離子峰進一步碎裂產(chǎn)生豐富的碎片離子。因此，我們很難在GC/MS上看到分子離子峰。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”，將儀器得到的實際指紋圖譜和質(zhì)譜庫（如NIST庫）進行比對后，我們將會得到一個叫相似度的指標。保留指數(shù)和相似度都必須滿足設(shè)定的閾值，軟件才會給出色譜峰的定性結(jié)果。然后采用標準品質(zhì)譜信息進行完全比對定性，也就是說只有經(jīng)過標準品比對，代謝物才是被100%定性。北京常規(guī)靶向代謝組學(xué)主要技術(shù)代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。
代謝組學(xué)可以檢測的樣品種類有哪些？代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物（分子量<1000）。其樣品主要是血漿或血清，尿液，唾液，以及細胞和組織的提取液。我們也和一些公司或單位（如茶葉公司、制酒公司、酸奶公司、醫(yī)院等）合作，做過植物，微生物提取物，腦脊液，昆蟲血淋巴，羊水，卵泡液，膝蓋滑液，眼淚，胎盤，糞便及腸道內(nèi)容物提取液等。一般代謝組學(xué)能檢測出多少物質(zhì)？同的質(zhì)譜平臺靈敏度及偏向性都不一樣，而且不同平臺之間具有互補性。一般來說GC/MS檢測血清樣品能準確定性的物質(zhì)約200個左右，檢測尿液樣品定性的物質(zhì)約200個左右，其他樣品（如肝臟，糞便，腸道內(nèi)容物）也在幾百這個數(shù)量級。如果采用全二維GC/MS，物質(zhì)的數(shù)量要更多，可達1千以上。LC/MS檢測物質(zhì)的數(shù)量要遠比GC/MS多，但能準確定性和定量的不多，視不同的平臺(TQ、QTOF等)能達到幾十至2-3百個物質(zhì)。
什么是非靶向代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)？(1) 非靶向代謝組學(xué)（Untargeted metabolomics）即非目標代謝組學(xué)或發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)，無偏向性地對所有小分子代謝物（一般相對分子量小于1000）同時進行檢測分析的代謝組學(xué)。(2) 靶向代謝組學(xué)（Trgeted metabolomics）則為目標性代謝組學(xué)，著重對于設(shè)定好的目標代謝物進行定性、量檢測分析和研究。相比于其他組學(xué)，代謝組學(xué)有哪些特殊的優(yōu)勢？系統(tǒng)生物學(xué)有基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個重要的分支，與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢，主要體現(xiàn)在以下幾點：(1) 基因與蛋白質(zhì)表達的微小變化會在相應(yīng)代謝物水平上得到放大，更容易被檢測。(2) 代謝物的種類要遠小于基因和蛋白的數(shù)目。(3) 可與生物表型變化建立直接相關(guān)性。代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是色譜（HPLC，GC）。
選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢有哪些？代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游，介于基因、蛋白質(zhì)和細胞、組織之間，在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。小分子的產(chǎn)生和代謝是基因表達的下游產(chǎn)物，生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接，更準確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。代謝物的種類少，大約在103個數(shù)量級，要遠小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù)，物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡單得多，分析起來更簡單明了。代謝組學(xué)的代謝物信息庫簡單，它遠沒有全基因組測序及大量表達序列標簽的數(shù)據(jù)庫那么復(fù)雜?；蚝偷鞍踪|(zhì)表達的有效微小變化會在代謝物上得到放大，從而使檢測更容易。代謝產(chǎn)物在各個生物體系中都是類似的，所以代謝組學(xué)研究中采用的技術(shù)更容易在各個領(lǐng)域中通用，也更容易被人接受。代謝組學(xué)是用來解決什么問題的？河南植物靶向代謝組學(xué)領(lǐng)域
代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于藥物毒理學(xué)。貴州LC-MS／MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析
代謝組學(xué)有哪些應(yīng)用？近年來，代謝組學(xué)技術(shù)得到了迅速發(fā)展，主要可應(yīng)用于：功能基因組學(xué)、疾病早期診斷、病因病機研究、藥物毒理學(xué)、中醫(yī)藥現(xiàn)代化、植物代謝組學(xué)、微生物代謝組學(xué)、營養(yǎng)學(xué)、環(huán)境科學(xué)等生命科學(xué)的各個領(lǐng)域。為什么要選擇代謝組學(xué)？首先需要明確的是代謝組學(xué)的目標分析物主要為生物小分子及其代謝產(chǎn)物，如糖、有機酸、脂質(zhì)、維生素、氨基酸、芳香烴之類等化合物。所以，如果關(guān)注的是小分子物質(zhì)，那么采用代謝組學(xué)的方法，可以對樣品內(nèi)檢測到的小分子物質(zhì)進行定性、定量分析。同于基因組學(xué)和蛋白組學(xué)，代謝組學(xué)的研究反映某一時刻下正在發(fā)生的生命活動情況，研究代謝物的表達量、代謝物與生理病理變化的關(guān)系，能夠幫助尋找新的生物標記物，發(fā)現(xiàn)新的代謝途徑，以及更進一步深入了解目前已知的這些途徑，應(yīng)用于疾病的早期診斷、藥物靶點的發(fā)現(xiàn)、疾病的病理生理研究。貴州LC-MS／MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析
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