南京GC-MS非靶向代謝組學(xué)主要技術(shù)

來源: 發(fā)布時間:2022-03-17

代謝組學(xué)比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法:代謝組學(xué)分析數(shù)據(jù)用于統(tǒng)計分析時,數(shù)據(jù)集通常為一個N × K的矩陣(X矩陣),N表示N個樣本數(shù),每一行表示一個樣品, K表示K個變量,每一列表示一個變量,在代謝組學(xué)中變量通常是指代謝物含量。單變量分析方法只分別分析單個變量,不考慮多個變量的相互作用與內(nèi)在聯(lián)系。具有簡單性、易應(yīng)用性和可解釋性。但是無法基于整體數(shù)據(jù)對所測樣品的優(yōu)劣、差異進行綜合評價和分析。差異倍數(shù)變化大?。‵old Change,F(xiàn)C)表示實驗組與對照組的含量比值,可以快速考察各個代謝物在不同組別之間的含量變化大小。相比于其他組學(xué),代謝組學(xué)有哪些特殊的優(yōu)勢?南京GC-MS非靶向代謝組學(xué)主要技術(shù)

代謝組學(xué)在系統(tǒng)生物學(xué)中有什么作用?它的地位如何?代謝物作為生物體表型的基礎(chǔ)能夠幫助我們更直觀有效地了解生命現(xiàn)象揭示生命本質(zhì)。代謝組學(xué)本質(zhì)上是指從整體上研究生物體的代謝物,是對某一生物、組織或細胞中的所有低分子量代謝產(chǎn)物進行定性與定量分析的一門科學(xué)。代謝組學(xué)以指標(biāo)分析為基礎(chǔ),高通量檢測為手段,通過研究生物體內(nèi)代謝物的種類與數(shù)量及其變化規(guī)律來闡述機體在正常生命狀態(tài)及環(huán)境變化后的代謝過程。代謝組是系統(tǒng)生物學(xué)的分支學(xué)科之一。其研究內(nèi)容主要包括對代謝物進行定性或定量分析,不同基因型的生物體進行代謝組學(xué)表型研究,不同生長環(huán)境及加物理、化學(xué)或生物性刺激后個體代謝產(chǎn)物的應(yīng)答,進行代謝途徑或代謝網(wǎng)絡(luò)解析與轉(zhuǎn)基因評價。深圳GC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)服務(wù)代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)后出現(xiàn)的新興“組學(xué)”。

代謝組學(xué)樣本收集注意事項:(1)血液離開動物或人體后,應(yīng)盡快開展血清、血漿的分離,并嚴格按照操作說明進行。(2)采集到的血清為黃色透明液體、血漿為淡黃色半透明液體,如果發(fā)現(xiàn)樣本中是紅色,說明在已經(jīng)發(fā)生了了溶血現(xiàn)象,樣本需重新制備。(3)血清與血漿的主要區(qū)別在于血清中不含纖維蛋白原。血清和血漿中脂質(zhì),氨基酸,核苷酸等代謝譜存在差別。糞便樣本收集:1.人糞便:(1)用無菌勺挖取新鮮的,排泄中后部的內(nèi)側(cè)糞便(避免尿液及其他壁對樣本污染);(2)分裝樣本20mg/管。(3)迅速放入液氮中冷凍處理至少15min.(4)-80℃冰箱凍存。寄樣需足量干冰。

靶向代謝組學(xué):靶向代謝組學(xué)(Targeted Metabolomics)是代謝組學(xué)研究的重要組成部分,也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對于全代謝組分析而言,靶向代謝組分析具有特異性強,檢測靈敏度高和定量準(zhǔn)確等幾個特點。通過對血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準(zhǔn)確定量定性分析,一方面可以結(jié)合其它實驗數(shù)據(jù)揭示相關(guān)的分子生物學(xué)作用機制,另一方面,也可以為后續(xù)代謝分子標(biāo)志物的深入研究和開發(fā)利用提供有力支持。靶向代謝組學(xué)可以用于:驗證有非靶向代謝組學(xué)實驗提出的假說;進行基于假說的探索性實驗,針對特定代謝物,研究代謝模型。代謝組學(xué)效仿了基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想。

代謝組學(xué)的研究對象與層次有哪些?一般來說,代謝組學(xué)關(guān)注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據(jù)研究的對象和目的不同,科學(xué)家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個層次:代謝物靶標(biāo)分析:某一個或幾個特定組分的定性和定量分析,如某一類結(jié)構(gòu)、性質(zhì)相關(guān)的化合物(氨基酸、有機酸、順二醇類)或者某一代謝途徑的所有中間產(chǎn)物或多條代謝途徑的標(biāo)志性組分。代謝物指紋分析:同時對多個代謝物進行分析,不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析:限定條件下對生物體內(nèi)特定組織內(nèi)的代謝產(chǎn)物的快速定性和半定量分析。代謝組分析:對生物體或體內(nèi)某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析,并研究該代謝物組在外界干預(yù)或病理生理條件下的動態(tài)變化規(guī)律。代謝組學(xué)可以檢測的樣品種類有哪些?廣州非靶向代謝組學(xué)技術(shù)分析

代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個重要的分支,與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢。南京GC-MS非靶向代謝組學(xué)主要技術(shù)

代謝組學(xué):代謝組學(xué) (metabolomics)的出現(xiàn)是生命科學(xué)研究的必然。是對某一生物或細胞中相對分子量小于1,000的小分子代謝產(chǎn)物進行定性和定量分析的一門新學(xué)科。代謝組作為系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,在臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有普遍的應(yīng)用前景。 代謝產(chǎn)物是基因表達的產(chǎn)物,在代謝酶的作用下生成。雖然與基因或蛋白質(zhì)相比,代謝產(chǎn)物較小,但是不能形成代謝產(chǎn)物的細胞是死細胞,因此不能小看代謝產(chǎn)物的重要性。 研究人員通過對機體代謝產(chǎn)物的深入研究,可以判斷機體是否處于正常狀態(tài),而對基因和蛋白質(zhì)的研究都無法得出這樣的結(jié)論。事實上,代謝組學(xué)研究已經(jīng)能診斷出一些代謝類疾病,如糖尿病、肥胖癥,代謝綜合癥。目前,已經(jīng)研究清楚的普通代謝途徑包括三羧酸循環(huán)(TCA),糖酵解,花生四烯酸 (AA)/炎癥途徑。南京GC-MS非靶向代謝組學(xué)主要技術(shù)

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