湖北蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)鑒定

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-03-15

蛋白磷酸化修飾過(guò)程:蛋白磷酸化修飾這一過(guò)程是通過(guò)蛋白激酶催化,將磷酸基團(tuán)從ATP轉(zhuǎn)移到多肽底物的絲氨酸、蘇氨酸,或酪氨酸殘基上。并且磷酸化修飾的過(guò)程是可逆的,去磷酸化反應(yīng)由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化檢測(cè)方法:Western Blot檢測(cè)方法:Western Blot是檢測(cè)蛋白磷酸化水平的常用方法,主要過(guò)程為先利用SDS-PAGE分離蛋白質(zhì),隨后將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,然后使用特異性識(shí)別磷酸化蛋白的抗體來(lái)鑒定目標(biāo)蛋白的磷酸化水平。只有被磷酸化修飾的蛋白才會(huì)在相應(yīng)分子質(zhì)量的地方顯現(xiàn)特異性蛋白條帶。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的定位。湖北蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)鑒定

蛋白質(zhì)磷酸化修飾定義?在哺乳動(dòng)物細(xì)胞生命周期中,大約有1/3的蛋白質(zhì)發(fā)生過(guò)磷酸化修飾,在脊椎動(dòng)物基因中,約有5%的基因編碼的蛋白質(zhì)是參與磷酸化和去磷酸化過(guò)程的蛋白激酶和磷酸酶。它可以通過(guò)激發(fā)、調(diào)節(jié)諸多信號(hào)通路進(jìn)而參與調(diào)控生物體的生長(zhǎng)、發(fā)育、逆境應(yīng)激、疾病發(fā)生等多種生命過(guò)程,一直是生物學(xué)研究的重點(diǎn)與熱點(diǎn)。蛋白磷酸化是指在激酶催化作用下把ATP或者GTP的磷酸基團(tuán)(P04)轉(zhuǎn)移到不同種類的氨基酸上(主要包括絲氨酸S、蘇氨酸T、酪氨酸Y),從而使蛋白質(zhì)發(fā)生翻譯后修飾的過(guò)程。河南蛋白質(zhì)甲基化修飾組學(xué)有哪些類型常見(jiàn)的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括乙?;?。

蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法:質(zhì)譜鑒定法:在質(zhì)譜分析中,先使試樣中各組分電離生成不同荷質(zhì)比的離子,然后經(jīng)加速電場(chǎng)的作用,生成離子束,進(jìn)入質(zhì)量分析器。在質(zhì)量分析器中,在磁場(chǎng)的作用下,質(zhì)荷比相同的離子會(huì)被聚焦到同一點(diǎn)上,不同質(zhì)荷比的離子聚焦于不同點(diǎn)上,因此獲得區(qū)分不同質(zhì)荷比離子的質(zhì)譜圖。與未經(jīng)修飾的肽段相比,磷酸基團(tuán)修飾的肽段在相對(duì)分子質(zhì)量上就會(huì)增加79.983,由此在質(zhì)譜圖中能夠與未修飾肽段進(jìn)行區(qū)分。固相金屬離子親和色譜利用的是磷酸基團(tuán)與固相化的金屬離子有高親和力,可有效吸附磷酸化基團(tuán),從而達(dá)到富集磷酸化肽段的效果。鰲合底物上的金屬離子通常是Fe3+或Ga3+,可以選擇性地與磷酸化肽中的磷酸部分相結(jié)合,并且在高pH或磷酸緩沖液中磷酸化肽可以釋放出來(lái)。但是這個(gè)方法不能夠有效富集不與IMAC結(jié)合的磷酸化肽段。

質(zhì)譜分析乙?;鞍踪|(zhì)組:質(zhì)譜分析技術(shù)可以對(duì)蛋白質(zhì)組中的乙?;鞍走M(jìn)行鑒定、乙酰化位點(diǎn)定位以及定量。當(dāng)質(zhì)譜用于乙酰化定量蛋白組研究中時(shí),因?yàn)橐阴;鞍踪|(zhì)在生物樣本中含量低、動(dòng)態(tài)范圍廣,需要先對(duì)乙酰化肽段進(jìn)行富集,然后再對(duì)富集得到的乙?;亩螛悠愤M(jìn)行定量分析。質(zhì)譜定量乙?;鞍捉M采用肽段預(yù)分離降低高豐度蛋白的影響,結(jié)合免疫共沉淀通過(guò)高效的抗體富集乙酰化的肽段,從而實(shí)現(xiàn)大規(guī)模乙酰化的鑒定及定量。為了鑒定和定量更多的乙?;亩?,在酶切過(guò)程中還可使用多種不同的酶對(duì)蛋白樣品進(jìn)行酶切。蛋白質(zhì)磷酸化修飾的免疫印跡技術(shù)優(yōu)點(diǎn):檢測(cè)特異性高。

蛋白質(zhì)翻譯后修飾:蛋白質(zhì)的翻譯后修飾通過(guò)可逆的共價(jià)鍵將小分子或蛋白質(zhì)與底物蛋白質(zhì)上特定的氨基酸結(jié)合,調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化。各種蛋白質(zhì)翻譯后修飾在信號(hào)通路和網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮著重要的作用,翻譯后修飾系統(tǒng)的紊亂將導(dǎo)致一系列疾病的發(fā)生。通過(guò)實(shí)驗(yàn)的方法鑒定蛋白質(zhì)翻譯后修飾的位點(diǎn)需要耗費(fèi)大量的資金和時(shí)間,并且酶反應(yīng)的優(yōu)化常常難以實(shí)現(xiàn)。而計(jì)算的方法則能夠快速、準(zhǔn)確的預(yù)測(cè)酶特異性的底物蛋白質(zhì)及其修飾位點(diǎn)。質(zhì)譜是蛋白質(zhì)翻譯后修飾檢測(cè)的常用技術(shù)之一。山東丙?;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)技術(shù)服務(wù)

自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析。湖北蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)鑒定

蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法:免疫印跡技術(shù):技術(shù)優(yōu)勢(shì)特點(diǎn)。1、 檢測(cè)特異性高。2、能夠特異鑒定單個(gè)磷酸化位點(diǎn)。同位素標(biāo)記(Isotope Labeled)結(jié)合免疫印跡法:此方法的原理是當(dāng)?shù)鞍装l(fā)生磷酸化時(shí),放射性32P的摻入和分子質(zhì)量變化引起的凝膠遷移(gelshift),再通過(guò)免疫印跡方法檢測(cè)同位素標(biāo)記,從而達(dá)到鑒定磷酸化蛋白的目的。技術(shù)優(yōu)勢(shì)特點(diǎn):1、檢測(cè)技術(shù)靈敏并且直觀。2、常用于體外磷酸化反應(yīng)結(jié)果檢測(cè)。3、 磷酸化鑒定不受抗體限制。4、可同時(shí)分析多個(gè)蛋白磷酸化。湖北蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)鑒定

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