廣州LC-MS／MS非靶向代謝組學(xué)

什么是代謝組學(xué)？代謝組學(xué)是用來解決什么問題的？代謝組學(xué)（Metabonomics/Metabolomics）是發(fā)展起來的一門新興學(xué)科，是研究關(guān)于生物體被擾動后（如基因的改變或環(huán)境變化后）其代謝產(chǎn)物（內(nèi)源性代謝物質(zhì)）種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律。代謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來反映某種病理生理過程中所發(fā)生的一系列生物事件。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比，代謝組學(xué)將在臨床上發(fā)揮更大的作用。廣州LC-MS／MS非靶向代謝組學(xué)

如何獲得高質(zhì)量GC/MS代謝組學(xué)數(shù)據(jù)？實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)先不談，在儀器分析階段，若想獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)，有以下幾個方面需要注意。1）前處理方法的一致性。不同實(shí)驗(yàn)人員操作方式不盡相同。因此，一個項(xiàng)目應(yīng)當(dāng)只由一個人負(fù)責(zé)前處理。推薦使用自動衍生設(shè)備，以減少人為的誤差。2）檢測之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài)。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能，可以快速便捷地核查質(zhì)譜儀器的狀態(tài)。但更重要的是氣相色譜狀態(tài)，推薦使用一組混標(biāo)作為儀器質(zhì)控。在每一個項(xiàng)目開始之前，先進(jìn)行質(zhì)控樣檢測，確認(rèn)氣相色譜的分離度和質(zhì)譜的整體響應(yīng)。3）后期數(shù)據(jù)矯正，特別是對于大樣本項(xiàng)目。我們可以在檢測序列中加入隨行質(zhì)控樣本（每個樣品取少量后混合），在后期數(shù)據(jù)處理時(shí)，使用質(zhì)控樣本結(jié)合如LOESS之類的算法對整體數(shù)據(jù)進(jìn)行矯正。深圳常規(guī)靶向代謝組學(xué)應(yīng)用什么是非靶向代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)？

代謝組學(xué)在系統(tǒng)生物學(xué)中有什么作用？它的地位如何？代謝物作為生物體表型的基礎(chǔ)能夠幫助我們更直觀有效地了解生命現(xiàn)象揭示生命本質(zhì)。代謝組學(xué)本質(zhì)上是指從整體上研究生物體的代謝物，是對某一生物、組織或細(xì)胞中的所有低分子量代謝產(chǎn)物進(jìn)行定性與定量分析的一門科學(xué)。代謝組學(xué)以指標(biāo)分析為基礎(chǔ)，高通量檢測為手段，通過研究生物體內(nèi)代謝物的種類與數(shù)量及其變化規(guī)律來闡述機(jī)體在正常生命狀態(tài)及環(huán)境變化后的代謝過程。代謝組是系統(tǒng)生物學(xué)的分支學(xué)科之一。其研究內(nèi)容主要包括對代謝物進(jìn)行定性或定量分析，不同基因型的生物體進(jìn)行代謝組學(xué)表型研究，不同生長環(huán)境及加物理、化學(xué)或生物性刺激后個體代謝產(chǎn)物的應(yīng)答，進(jìn)行代謝途徑或代謝網(wǎng)絡(luò)解析與轉(zhuǎn)基因評價(jià)。

藥物代謝和代謝組學(xué)區(qū)別：代謝組學(xué)與藥物代謝不同是它關(guān)注的對象不是外源性的藥物而是生物體本身就有的內(nèi)源性代謝物。這些代謝物是糖，脂肪，蛋白質(zhì)，核酸，膽汁酸等等代謝得到的。還有共生菌代謝的，是一個龐大的混合物。目的是通過樣本的對比，發(fā)現(xiàn)潛在標(biāo)志物，指導(dǎo)疾病早期診斷甚至基因水平的研究。而藥物代謝的目標(biāo)是只要只要追蹤到這種藥物分子在體內(nèi)變化就好，相當(dāng)具有靶向性，因此使用的技術(shù)手段就是LC-MS。檢測藥物的中間體，和具體的藥效，藥代動的效應(yīng)。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比， 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性。

GC-MS非靶向代謝組學(xué)能檢測到哪些類別的代謝物？衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測分析范圍。GC/MS能檢測到有機(jī)酸、氨基酸、單糖、糖醇、胺類、脂肪酸、吲哚、單甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和膽汁酸等代謝物。如何提高定性準(zhǔn)確度？GC/MS的定性有雙重標(biāo)準(zhǔn)，一是保留指數(shù)，二是質(zhì)譜信息的相似度（similarity）。不同于LC/MS的軟電離源，GC/MS使用的EI源屬于硬電離，能量較強(qiáng)且穩(wěn)定，在將代謝物分子電離后，分子離子峰進(jìn)一步碎裂產(chǎn)生豐富的碎片離子。因此，我們很難在GC/MS上看到分子離子峰。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”，將儀器得到的實(shí)際指紋圖譜和質(zhì)譜庫（如NIST庫）進(jìn)行比對后，我們將會得到一個叫相似度的指標(biāo)。保留指數(shù)和相似度都必須滿足設(shè)定的閾值，軟件才會給出色譜峰的定性結(jié)果。然后采用標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)譜信息進(jìn)行完全比對定性，也就是說只有經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)品比對，代謝物才是被100%定性。代謝組學(xué)在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。深圳個性化定制靶向代謝組學(xué)分析鑒定

代謝組學(xué)是系統(tǒng)生物學(xué)的組成部分。廣州LC-MS／MS非靶向代謝組學(xué)

GC-MS非靶向代謝組學(xué)醫(yī)學(xué)分析生物樣本為何要衍生化處理？有哪些衍生化的方法？GC的流動相為氣體（通常為高純氦），這就要求被分析物必須能夠氣化，而生物樣本中很多內(nèi)源性代謝物都含有極性基團(tuán)，具有沸點(diǎn)高、不易氣化特點(diǎn)。衍生化能夠降低這些代謝物的沸點(diǎn)，增加它們的熱穩(wěn)定性，以便分析能夠順利進(jìn)行。衍生化方法及試劑種類繁多，根據(jù)不同的分析目標(biāo)，需選擇合適的衍生化方法。如分析脂肪酸，我們可以采用甲酯化衍生。在GC/MS代謝平臺上，比較常用的衍生化方法是硅烷化衍生，因?yàn)樗膹V譜高效。在進(jìn)行硅烷化衍生之前，還需添加甲氧胺吡啶溶液，以封閉羰基（針對α-酮酸和糖類，保護(hù)作用），減少衍生化副產(chǎn)物的生成。廣州LC-MS／MS非靶向代謝組學(xué)

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