湖北LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)分析

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-02-25

靶向代謝組學(xué):靶向代謝組學(xué)(Targeted Metabolomics)是代謝組學(xué)研究的重要組成部分,也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對(duì)于全代謝組分析而言,靶向代謝組分析具有特異性強(qiáng),檢測(cè)靈敏度高和定量準(zhǔn)確等幾個(gè)特點(diǎn)。通過對(duì)血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準(zhǔn)確定量定性分析,一方面可以結(jié)合其它實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)揭示相關(guān)的分子生物學(xué)作用機(jī)制,另一方面,也可以為后續(xù)代謝分子標(biāo)志物的深入研究和開發(fā)利用提供有力支持。靶向代謝組學(xué)可以用于:驗(yàn)證有非靶向代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)提出的假說;進(jìn)行基于假說的探索性實(shí)驗(yàn),針對(duì)特定代謝物,研究代謝模型。代謝組學(xué)是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性、特性和規(guī)律。湖北LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)分析

代謝組學(xué)樣品收集方法及所需樣本量是什么?(1) 血清樣品: 避免反復(fù)凍融。血液收集在離心管中靜置30分鐘進(jìn)行凝血。8000rpm離心10分鐘,取上清分裝到凍存管中,放置液氮中或-80度凍存;單個(gè)樣本要求體積為50μL。(2) 尿液樣品:臨床樣本請(qǐng)全部取清晨第1次尿液。尿液直接分裝到離心管中,8000rpm離心10分鐘,取上清分裝到凍存管中,放置液氮中或-80度凍存,-80度凍存;單個(gè)樣本要求體積為100μL。(3) 其他樣本收集辦法請(qǐng)咨詢譜領(lǐng)工作人員。江蘇植物靶向代謝組學(xué)分析代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于疾病早期診斷。

GC-MS非靶向代謝組學(xué)能檢測(cè)到哪些類別的代謝物?衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測(cè)分析范圍。GC/MS能檢測(cè)到有機(jī)酸、氨基酸、單糖、糖醇、胺類、脂肪酸、吲哚、單甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和膽汁酸等代謝物。如何提高定性準(zhǔn)確度?GC/MS的定性有雙重標(biāo)準(zhǔn),一是保留指數(shù),二是質(zhì)譜信息的相似度(similarity)。不同于LC/MS的軟電離源,GC/MS使用的EI源屬于硬電離,能量較強(qiáng)且穩(wěn)定,在將代謝物分子電離后,分子離子峰進(jìn)一步碎裂產(chǎn)生豐富的碎片離子。因此,我們很難在GC/MS上看到分子離子峰。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”,將儀器得到的實(shí)際指紋圖譜和質(zhì)譜庫(如NIST庫)進(jìn)行比對(duì)后,我們將會(huì)得到一個(gè)叫相似度的指標(biāo)。保留指數(shù)和相似度都必須滿足設(shè)定的閾值,軟件才會(huì)給出色譜峰的定性結(jié)果。然后采用標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)譜信息進(jìn)行完全比對(duì)定性,也就是說只有經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)品比對(duì),代謝物才是被100%定性。

代謝組學(xué)有哪些應(yīng)用?近年來,代謝組學(xué)技術(shù)得到了迅速發(fā)展,主要可應(yīng)用于:功能基因組學(xué)、疾病早期診斷、病因病機(jī)研究、藥物毒理學(xué)、中醫(yī)藥現(xiàn)代化、植物代謝組學(xué)、微生物代謝組學(xué)、營養(yǎng)學(xué)、環(huán)境科學(xué)等生命科學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域。為什么要選擇代謝組學(xué)?首先需要明確的是代謝組學(xué)的目標(biāo)分析物主要為生物小分子及其代謝產(chǎn)物,如糖、有機(jī)酸、脂質(zhì)、維生素、氨基酸、芳香烴之類等化合物。所以,如果關(guān)注的是小分子物質(zhì),那么采用代謝組學(xué)的方法,可以對(duì)樣品內(nèi)檢測(cè)到的小分子物質(zhì)進(jìn)行定性、定量分析。同于基因組學(xué)和蛋白組學(xué),代謝組學(xué)的研究反映某一時(shí)刻下正在發(fā)生的生命活動(dòng)情況,研究代謝物的表達(dá)量、代謝物與生理病理變化的關(guān)系,能夠幫助尋找新的生物標(biāo)記物,發(fā)現(xiàn)新的代謝途徑,以及更進(jìn)一步深入了解目前已知的這些途徑,應(yīng)用于疾病的早期診斷、藥物靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)、疾病的病理生理研究。代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于病因病機(jī)研究。

代謝組學(xué)比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法:代謝組學(xué)分析數(shù)據(jù)用于統(tǒng)計(jì)分析時(shí),數(shù)據(jù)集通常為一個(gè)N × K的矩陣(X矩陣),N表示N個(gè)樣本數(shù),每一行表示一個(gè)樣品, K表示K個(gè)變量,每一列表示一個(gè)變量,在代謝組學(xué)中變量通常是指代謝物含量。單變量分析方法只分別分析單個(gè)變量,不考慮多個(gè)變量的相互作用與內(nèi)在聯(lián)系。具有簡(jiǎn)單性、易應(yīng)用性和可解釋性。但是無法基于整體數(shù)據(jù)對(duì)所測(cè)樣品的優(yōu)劣、差異進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)和分析。差異倍數(shù)變化大小(Fold Change,F(xiàn)C)表示實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組的含量比值,可以快速考察各個(gè)代謝物在不同組別之間的含量變化大小。代謝組學(xué)可以檢測(cè)的樣品種類有哪些?廣州常規(guī)靶向代謝組學(xué)分析

代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于功能基因組學(xué)。湖北LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)分析

GC-MS非靶向代謝組學(xué)醫(yī)學(xué)分析生物樣本為何要衍生化處理?有哪些衍生化的方法?GC的流動(dòng)相為氣體(通常為高純氦),這就要求被分析物必須能夠氣化,而生物樣本中很多內(nèi)源性代謝物都含有極性基團(tuán),具有沸點(diǎn)高、不易氣化特點(diǎn)。衍生化能夠降低這些代謝物的沸點(diǎn),增加它們的熱穩(wěn)定性,以便分析能夠順利進(jìn)行。衍生化方法及試劑種類繁多,根據(jù)不同的分析目標(biāo),需選擇合適的衍生化方法。如分析脂肪酸,我們可以采用甲酯化衍生。在GC/MS代謝平臺(tái)上,比較常用的衍生化方法是硅烷化衍生,因?yàn)樗膹V譜高效。在進(jìn)行硅烷化衍生之前,還需添加甲氧胺吡啶溶液,以封閉羰基(針對(duì)α-酮酸和糖類,保護(hù)作用),減少衍生化副產(chǎn)物的生成。湖北LC-MS/MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)分析

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