深圳DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法

我國科學(xué)家已經(jīng)在重大疾病如肝病、維甲酸誘導(dǎo)白血病細(xì)胞凋亡啟動模型及維甲酸定向誘導(dǎo)胚胎干細(xì)胞向神經(jīng)系統(tǒng)分化的模型等比較蛋白質(zhì)組研究以及一些重要生理和病理體系的蛋白質(zhì)組成分研究方面獲得了重要成就。蛋白質(zhì)組學(xué)的重要應(yīng)用領(lǐng)域有：在臨床疾病中的應(yīng)用、在微生物蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用、在植物研究中的應(yīng)用、在腎臟病學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用。我們通過研究蛋白質(zhì)組，可以為患者提供有用的疾病診斷、診療、預(yù)后評估信息；可以早期更為準(zhǔn)確的診斷出胰腺??；也可以為AD的診斷、診療藥物的設(shè)計(jì)和篩選奠定基礎(chǔ)。這項(xiàng)研究技術(shù)其實(shí)離我們生活非常近，對我們生命而言尤為重要。近年來，高通量蛋白質(zhì)分離與鑒定技術(shù)，如雙向電泳、生物質(zhì)譜、蛋白質(zhì)芯片、酵母雙雜交系統(tǒng)、生物信息學(xué)等相繼建立并日趨完善，加速了蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展。iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用比較普遍的技術(shù)。深圳DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用？具體而言，蛋白質(zhì)組學(xué)在此類應(yīng)用中，更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息。作為檢測手段的蛋白質(zhì)組學(xué)：事實(shí)上，在當(dāng)前的生物醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷中，蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)有非常多的應(yīng)用。因?yàn)榈鞍踪|(zhì)組學(xué)技術(shù)的本質(zhì)（從分析化學(xué)角度來看），就是對蛋白質(zhì)的定性定量分析。生物醫(yī)學(xué)和臨床診斷中，需要大量表征一種或多種蛋白質(zhì)的含量、氨基酸序列、翻譯后修飾等信息。蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)目前在一小部分]應(yīng)用中具有獨(dú)特優(yōu)勢。有很多蛋白質(zhì)組學(xué)的研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進(jìn)行相關(guān)研究和日常工作。很容易發(fā)現(xiàn)，當(dāng)前蛋白質(zhì)組學(xué)的臨床應(yīng)用更多地集中在第二類。第1類的應(yīng)用更接近于生物醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究，目前還沒有和大部分人的現(xiàn)實(shí)生活產(chǎn)生關(guān)系。湖北蛋白質(zhì)定量組學(xué)一般流程目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)方面的應(yīng)用性研究。

蛋白組學(xué)技術(shù)：質(zhì)譜技術(shù)相較于傳統(tǒng)蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)而言，擁有靈敏、準(zhǔn)確、高通量、自動化等特點(diǎn)。質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)的基本原理是先將樣品分子離子化，然后根據(jù)不同離子之間的質(zhì)荷比差異來分離并確定蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量。根據(jù)蛋白質(zhì)酶解后所得到的肽質(zhì)量指紋圖譜、肽序列標(biāo)簽、和肽階梯序列去檢索蛋白質(zhì)或核酸序列數(shù)據(jù)庫，質(zhì)譜技術(shù)可達(dá)到對蛋白質(zhì)的快速鑒定和高通量篩選。因產(chǎn)生離子的方法不同而發(fā)展起來的質(zhì)譜包括基質(zhì)輔助激光解吸離子化質(zhì)譜、電噴霧離子化質(zhì)譜、表面增強(qiáng)激光解吸離子化質(zhì)譜等。

蛋白組學(xué)樣本寄送前是否需要精確計(jì)數(shù)或是稱量？不同樣本寄送會有不同的送樣要求，按照收集方法提供可以保證實(shí)驗(yàn)用量充足。不需要精確計(jì)數(shù)或是稱量，項(xiàng)目開展前會進(jìn)行蛋白濃度的測定，后續(xù)也是不同樣本等蛋白量處理、上機(jī)檢測，但是要保證每個(gè)樣本的寄樣量達(dá)到實(shí)驗(yàn)要求。常規(guī)定量蛋白組實(shí)驗(yàn)的主要步驟有哪些，數(shù)據(jù)分析內(nèi)容包含哪些？實(shí)驗(yàn)步驟：首先獲得生物學(xué)樣本，然后進(jìn)行蛋白提取，定量，SDS-PAGE跑膠質(zhì)控，還原烷基化，酶解，獲得肽段，（標(biāo)記+分組分），上機(jī)檢測，搜庫軟件搜庫，數(shù)據(jù)分析；數(shù)據(jù)分析：主要分為基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分析、?級數(shù)據(jù)分析和個(gè)性化數(shù)據(jù)分析三個(gè)部分?；A(chǔ)分析主要包括差異表達(dá)蛋白篩選、層次聚類分析分析、COG注釋分析、亞細(xì)胞定位分析、GO注釋富集分析、KEGG注釋分析、PPI分析等。蛋白質(zhì)組與基因組相對應(yīng)，也是一個(gè)整體的概念。

定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法學(xué)介紹：Label-free：Label-free定量，即非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué)，不需要對比較樣本做特定標(biāo)記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號便可得到樣品間蛋白表達(dá)量的變化，通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。Label-free定量不需要標(biāo)記處理，操作簡單，可以做任意樣本的總蛋白質(zhì)差異定量，但對實(shí)驗(yàn)操作的穩(wěn)定性、重復(fù)性要求較高，準(zhǔn)確性也較標(biāo)記定量差。因此，Label-free技術(shù)適合于大樣本量的定量比較，以及對無法用標(biāo)記定量實(shí)現(xiàn)的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。定量蛋白質(zhì)組學(xué)是蛋白質(zhì)組研究的重要內(nèi)容。哈爾濱定量N糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究

蛋白質(zhì)組的概念與基因組的概念有許多差別。深圳DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法

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