靶向代謝組學(xué):靶向代謝組學(xué)(Targeted Metabolomics)是代謝組學(xué)研究的重要組成部分,也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對(duì)于全代謝組分析而言,靶向代謝組分析具有特異性強(qiáng),檢測(cè)靈敏度高和定量準(zhǔn)確等幾個(gè)特點(diǎn)。通過(guò)對(duì)血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準(zhǔn)確定量定性分析,一方面可以結(jié)合其它實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)揭示相關(guān)的分子生物學(xué)作用機(jī)制,另一方面,也可以為后續(xù)代謝分子標(biāo)志物的深入研究和開(kāi)發(fā)利用提供有力支持。靶向代謝組學(xué)可以用于:驗(yàn)證有非靶向代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)提出的假說(shuō);進(jìn)行基于假說(shuō)的探索性實(shí)驗(yàn),針對(duì)特定代謝物,研究代謝模型。代謝組學(xué)是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性、特性和規(guī)律。廣州動(dòng)物靶向代謝組學(xué)
靶向代謝組學(xué)分析成功的關(guān)鍵因素是準(zhǔn)確度、高通量和可靠性。靶向代謝組學(xué)鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測(cè) (SIM),或在三重串聯(lián)四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應(yīng)離子監(jiān)測(cè) (MRM) 進(jìn)行靶向 MS/MS。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度,在單四極桿質(zhì)譜中,這種靈敏度增強(qiáng)的原因是延長(zhǎng)了所選擇離子的采集時(shí)間。因?yàn)楸O(jiān)測(cè)的是一個(gè)很小的質(zhì)量窗口,所以質(zhì)量色譜圖只表示對(duì)極為特定質(zhì)量的檢測(cè)。在大多數(shù)情況下,靈敏度可以提高 10 倍。MRM 是進(jìn)行質(zhì)譜定量的選擇方法,與 SIM 相比更為靈敏、更加特異??梢援a(chǎn)生獨(dú)特的碎片離子,可對(duì)非常復(fù)雜基質(zhì)中的目標(biāo)化合物進(jìn)行監(jiān)測(cè)和定量。深圳個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)費(fèi)用代謝組學(xué)效仿了基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想。
LC-MS非靶向代謝組學(xué):LCMS非靶向是通過(guò)液質(zhì)聯(lián)用(LC–MS)方法檢測(cè)生物體受擾動(dòng)或刺激前后大量代謝產(chǎn)物的動(dòng)態(tài)變化,從中找出表達(dá)差異的代謝物,進(jìn)而闡明生物體代謝相關(guān)過(guò)程的代謝組學(xué)技術(shù)。LCMS非靶向代謝組學(xué)適用于分析難揮發(fā)或熱穩(wěn)定性差的代謝產(chǎn)物,具有高通量、高分辨率、高靈敏度的特點(diǎn)。超高壓液相色譜或超高效液相色譜(UPLC)通過(guò)采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力,實(shí)現(xiàn)了更好的分離,具體包括更高的分離能力、更快的分離速度以及更好的靈敏度;串聯(lián)質(zhì)譜儀在MS掃描模式下,可實(shí)現(xiàn)高低碰撞能量快速切換,同時(shí)采集代謝物的一二級(jí)質(zhì)譜信息,結(jié)合代謝組學(xué)數(shù)據(jù)處理軟件對(duì)質(zhì)譜信息的解析,在單次分析中可檢測(cè)和鑒定幾百至幾千種代謝物。
代謝組學(xué)應(yīng)用方向:腸道菌群代謝組學(xué),運(yùn)用代謝組學(xué)檢測(cè)腸菌代謝物的動(dòng)態(tài)變化,了解腸道菌群在宿主中的代謝狀態(tài),直觀的研究腸道菌群與疾病發(fā)生的發(fā)展的關(guān)系,為疾病的預(yù)防,調(diào)高宿主的健康水平提供新的思路。經(jīng)典脂質(zhì)組學(xué):對(duì)生物體、組織或細(xì)胞中的脂質(zhì)以及與其相互作用的分子進(jìn)行全方面系統(tǒng)的鑒定分析。了解脂質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,揭示脂質(zhì)代謝與細(xì)胞乃至機(jī)體的生理、病理過(guò)程之間的關(guān)系,普遍運(yùn)用于分子生理學(xué)、功能基因組學(xué)以及環(huán)境與健康等重要領(lǐng)域。代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)后出現(xiàn)的新興“組學(xué)”。
代謝組學(xué):代謝組學(xué) (metabolomics)的出現(xiàn)是生命科學(xué)研究的必然。是對(duì)某一生物或細(xì)胞中相對(duì)分子量小于1,000的小分子代謝產(chǎn)物進(jìn)行定性和定量分析的一門(mén)新學(xué)科。代謝組作為系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,在臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有普遍的應(yīng)用前景。 代謝產(chǎn)物是基因表達(dá)的產(chǎn)物,在代謝酶的作用下生成。雖然與基因或蛋白質(zhì)相比,代謝產(chǎn)物較小,但是不能形成代謝產(chǎn)物的細(xì)胞是死細(xì)胞,因此不能小看代謝產(chǎn)物的重要性。 研究人員通過(guò)對(duì)機(jī)體代謝產(chǎn)物的深入研究,可以判斷機(jī)體是否處于正常狀態(tài),而對(duì)基因和蛋白質(zhì)的研究都無(wú)法得出這樣的結(jié)論。事實(shí)上,代謝組學(xué)研究已經(jīng)能診斷出一些代謝類(lèi)疾病,如糖尿病、肥胖癥,代謝綜合癥。目前,已經(jīng)研究清楚的普通代謝途徑包括三羧酸循環(huán)(TCA),糖酵解,花生四烯酸 (AA)/炎癥途徑。代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游。廣州動(dòng)物靶向代謝組學(xué)
與其他“組學(xué)”研究相比,代謝組學(xué)的費(fèi)用更低。廣州動(dòng)物靶向代謝組學(xué)
代謝組學(xué)有哪些研究方式?根據(jù)有沒(méi)有研究目標(biāo)或方向來(lái)確定,在不確定代謝物或者代謝途徑時(shí)可使用非靶向代謝組學(xué)尋找切入點(diǎn),在有目標(biāo)時(shí)則使用靶向定量進(jìn)行深入研究,針對(duì)性研究脂質(zhì)的則可以使用脂質(zhì)組學(xué)技術(shù)。另外比較新的,譜領(lǐng)生物還提供基于穩(wěn)定性同位素示蹤技術(shù)的代謝流組學(xué)技術(shù)服務(wù)來(lái)研究代謝流量問(wèn)題。什么是代謝組學(xué)?代謝組學(xué)是末期發(fā)展起來(lái)的一門(mén)新興學(xué)科,是研究關(guān)于生物體被擾動(dòng)后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類(lèi)、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律。代謝組學(xué)通過(guò)揭示內(nèi)在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來(lái)反映某種生理或病理的一系列發(fā)展過(guò)程。廣州動(dòng)物靶向代謝組學(xué)
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