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代謝組學(xué)的研究分為靶向和非靶向。通俗說就是你有沒有目標(biāo)分子。傳統(tǒng)代謝組學(xué)研究利用的是GC-MS,因為代謝物大多數(shù)都不是高沸點的,而且GC-MS有龐大的數(shù)據(jù)庫檢索。然后發(fā)展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸點物質(zhì)難以檢測的弊端。NMR用于代謝組學(xué)不是很多,一方面是NMR這個東西入行起點有點高,另一方面是樣品太復(fù)雜而且靈敏度不高。但是NMR樣品處理簡單,無損。不需要各種衍生化。而且NMR對于物質(zhì)結(jié)構(gòu)的指認(rèn)要比MS更精確(比如異構(gòu)體)因此對定性非常有用,成為非靶向代謝組學(xué)的重要方法。代謝組學(xué)可以檢測的樣品種類有哪些?山東脂質(zhì)代謝組學(xué)多分析價格
藥物代謝和代謝組學(xué)區(qū)別:代謝組學(xué)與藥物代謝不同是它關(guān)注的對象不是外源性的藥物而是生物體本身就有的內(nèi)源性代謝物。這些代謝物是糖,脂肪,蛋白質(zhì),核酸,膽汁酸等等代謝得到的。還有共生菌代謝的,是一個龐大的混合物。目的是通過樣本的對比,發(fā)現(xiàn)潛在標(biāo)志物,指導(dǎo)疾病早期診斷甚至基因水平的研究。而藥物代謝的目標(biāo)是只要只要追蹤到這種藥物分子在體內(nèi)變化就好,相當(dāng)具有靶向性,因此使用的技術(shù)手段就是LC-MS。檢測藥物的中間體,和具體的藥效,藥代動的效應(yīng)。廣州植物靶向代謝組學(xué)質(zhì)譜分析代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于藥物毒理學(xué)。
代謝組學(xué)究竟是一門什么樣的研究方向?首先定義什么是代謝組學(xué)。簡單的說就是研究生物體對內(nèi)外刺激的整體代謝應(yīng)答規(guī)律。那么為什么代謝組學(xué)是基因組,轉(zhuǎn)錄組,蛋白質(zhì)組的下游。我們研究它到底有什么意義。中心法則告訴我們了遺傳信息的流向,的執(zhí)行者蛋白質(zhì)中很多酶參與了體內(nèi)的代謝過程?;驕y序數(shù)量太大,而且基因水平解釋問題往往很吃力。因為基因的調(diào)控和生物學(xué)事件之間隔了一個很漫長的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)過程。蛋白同理,一是蛋白種類巨大,二是蛋白組學(xué)發(fā)展進(jìn)入瓶頸;發(fā)展代謝組是因為代謝物種類只有不到1w種,建立它的差異分析更加簡單,同時在價格等方面更有推廣的意義。
代謝組學(xué)發(fā)展前景:代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)后出現(xiàn)的新興“組學(xué)”,每年發(fā)表的代謝組學(xué)研究的文章數(shù)量都在不斷增加。代謝組學(xué)的發(fā)展很迅速,盡管還沒有經(jīng)典論文出現(xiàn),但是研究人員相信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)將在臨床上發(fā)揮更大的作用。許多公司通過市場研究發(fā)現(xiàn),健康人并不希望進(jìn)行基因型分析,所以,對于這些人群來說,基因組學(xué)研究在臨床上的應(yīng)用很有限。而代謝組學(xué)與臨床化學(xué)較為相似,且相對于基因組學(xué)來說,提供的個人信息更少,故其在臨床上的應(yīng)用有可能產(chǎn)生一定的影響。代謝組學(xué)可與生物表型變化建立直接相關(guān)性。
代謝組學(xué)樣本收集植物組織:果實、種子:1)對于含水量高、體積較大的果實(番茄、西瓜、蘋果等)需要先將樣品分成“均勻”的小塊(≈ 200 mg/樣本)分裝至2 mL離心管中,標(biāo)號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)對于細(xì)小的顆粒種子(擬南芥種子、谷物種子等),可以先將同一組的植株種子混勻后再分裝(≈ 200 mg/樣本)至離心管中,標(biāo)號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。3)對于要求對整個果實進(jìn)行提取的(整粒葡萄等),需要把果實裝在50 mL離心管/自封袋中,標(biāo)號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15min,-80 ℃凍存,干冰寄送。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個重要的分支,與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢。山東脂質(zhì)代謝組學(xué)多分析價格
靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標(biāo)性代謝組學(xué)。山東脂質(zhì)代謝組學(xué)多分析價格
代謝組學(xué)樣本收集指南:1.血漿樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到標(biāo)記的肝素鋰血漿收集管中(肝素鋰用作抗凝劑)。(2)立即于4 °C離心(3000g)20min,上清液即為血漿。(3)離心完畢,取出血漿收集管,取上清液(血漿),分等份(0.5mL或0.1mL),轉(zhuǎn)移到凍存管中(冰上),旋蓋。(4)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。2.血清樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到血清收集管中。(2)將血清收集管冰水?。?℃)凝集至少1h(2h以內(nèi)),記錄凝集時間。(3)將血清收集管放到冷凍離心機(jī)中低溫(4℃)離心15min(2500 g)。(4)離心完畢,取出血清收集管,取上清液,分等份(0.5mL或0.1mL),轉(zhuǎn)移到凍存管中(冰上),旋蓋。(5)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。山東脂質(zhì)代謝組學(xué)多分析價格
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