湖北DIA定量蛋白質(zhì)組學領域

來源: 發(fā)布時間:2022-01-26

定量蛋白質(zhì)組學技術:定量蛋白質(zhì)組學技術主要分為標記(label)和非標記(labelfree)定量策略,標記策略又分為體內(nèi)標記和體外標記兩種。細胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動態(tài)變化對各種生命過程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進程中,常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達異常。定量蛋白質(zhì)組學就是把一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復雜的混合體系中所有的蛋白質(zhì)進行精確的定量和鑒定。非標記(labelfree)的定量蛋白組學技術,Labelfree定量蛋白組學技術是通過液質(zhì)聯(lián)用技術對蛋白質(zhì)酶解肽段進行質(zhì)譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內(nèi)部標準,只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),比較不同樣品中相應肽段的信號強度,從而對肽段對應的蛋白質(zhì)進行相對定量。蛋白質(zhì)組學在生物學領域的研究中的應用是怎樣的?湖北DIA定量蛋白質(zhì)組學領域

蛋白組學研究怎么做?PRM:平行反應監(jiān)測(ParallelReactionMonitoring)是一種基于高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術,能夠?qū)δ繕说鞍踪|(zhì)、目標肽段(如發(fā)生翻譯后修飾的肽段)進行選擇性檢測,從而實現(xiàn)對目標蛋白質(zhì)/肽段進行一定定量,因此也被稱之為基于液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術的WesternBlot(LC-MSMSbasedWesternBlot,L-WB)。PRM技術基于Q-Orbitrap為表示的高分辨、高精度質(zhì)譜平臺,首先利用四級桿質(zhì)量分析器的選擇能力,用Q1選擇目標肽段的母離子,隨后在Collisioncell中對母離子進行碎裂,之后利用Orbitrap分析器在二級質(zhì)譜中檢測所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣即可對復雜樣本中的目標蛋白質(zhì)/肽段進行準確地特異性分析。深圳常規(guī)蛋白質(zhì)組學主要技術蛋白質(zhì)組可以隨著組織、甚至環(huán)境狀態(tài)的不同而改變。

定量蛋白質(zhì)組學分析:特點:(1)不同樣本標記之后混樣,統(tǒng)一處理上機,減少了分別上機造成的實驗誤差,并利用同位素標簽的豐度來檢測,定量更準確,重復性更好;(2)由于需要標記試劑標記,因此成本相對較高;(3)通量高,在一次實驗中比較多可同時比較8個樣品;(4)利用基于同一個參考樣品的辦法,可以進行多于8個樣品的定量比較;(5)iTRAQ的覆蓋度高、靈敏度高。Label-Free定量蛋白質(zhì)組學分析:Label-Free定量,即非標記的定量蛋白質(zhì)組學,不需要對比較樣本做特定標記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化,通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。

定量蛋白質(zhì)組學技術:TMT定量蛋白組學技術:TMT(TandemMassTags)定量蛋白質(zhì)組學技術多肽體外標記定量技術。這種技術采用多個(2-10)穩(wěn)定同位素標簽,特異性標記多肽的氨基基團進行串聯(lián)質(zhì)譜分析,能夠同時比較多達10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對含量,可用于研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達水平的差異。iTRAQ定量蛋白組學技術是多肽體外標記定量技術。這種技術同TMT定量蛋白組學技術相似,可研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達水平的差異。蛋白質(zhì)組學研究不僅是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益。

定量蛋白質(zhì)組學分析(QuantitativeProteomics)是對一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進行精確鑒定和定量??捎糜诤Y選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達蛋白,結合生物信息學揭示細胞生理病理等功能,同時也可對某些關鍵蛋白進行定性和定量分析。目前定量蛋白質(zhì)組學技術常見標記(Label)和非標記的(LabelFree)定量策略。定量蛋白質(zhì)組學技術常見的幾類主要包括:LabelFree定量蛋白組分析、SILAC與免疫共沉淀蛋白互作分析、MRM/PRM定量蛋白組學分析、SILAC/Dimethyl標記定量蛋白組分析、SWATH定量蛋白組學、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白組學分析。蛋白質(zhì)組學包括翻譯后的修飾。深圳常規(guī)蛋白質(zhì)組學主要技術

iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學應用比較普遍的技術。湖北DIA定量蛋白質(zhì)組學領域

蛋白質(zhì)組學發(fā)展趨勢:1、基礎研究方面:近兩年來蛋白質(zhì)組研究技術已被應用到各種生命科學領域,如細胞生物學、神經(jīng)生物學等。在研究對象上,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍,涉及到各種重要的生物學現(xiàn)象,如信號轉導、細胞分化、蛋白質(zhì)折疊等等。在未來的發(fā)展中,蛋白質(zhì)組學的研究領域?qū)⒏悠毡椤?、應用研究方面:蛋白質(zhì)組學將成為尋找疾病分子標記和藥物靶標比較有效的方法之一。在對早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質(zhì)組技術也有十分誘人的前景,目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進行蛋白質(zhì)組學方面的應用性研究。湖北DIA定量蛋白質(zhì)組學領域

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