廣東哪里有二代測序檢測

來源: 發(fā)布時(shí)間:2024-12-19

關(guān)于二代測序的簡介:

二代測序技術(shù)(Next-Generation Seguencing,NGS)也稱為高通量測序技術(shù),是一種能夠同時(shí)對數(shù)百萬甚至數(shù)十億個(gè) DNA片段進(jìn)行測序的方法。與傳統(tǒng)的桑格測序相比二代測序技術(shù)具有高通量、高準(zhǔn)確性、高靈敏度和低成本等優(yōu)勢。

二代測序技術(shù)在大幅提高了測序速度的同時(shí),大幅度的降低了測序成本,保持了高準(zhǔn)確性,以前完成一個(gè)人類基因組的測序需要3年時(shí)間,而使用二代測序技術(shù)則需要1周,但其序列讀長方面比起一代測序技術(shù)則要短很多,大多只100bp-150bp。


二代測序是一種能夠同時(shí)對數(shù)百萬甚至數(shù)十個(gè)億DNA片段進(jìn)行測序的方法。廣東哪里有二代測序檢測

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二代測序——蛋白質(zhì)甲基化

概念及位置:蛋白質(zhì)甲基化是指在蛋白質(zhì)的氨基酸殘基上添加甲基基團(tuán)。常見的甲基化修飾位點(diǎn)包括精氨酸(Arg)和賴氨酸(Lys)殘基。

作用

1、調(diào)節(jié)蛋白質(zhì) - 蛋白質(zhì)相互作用:例如,組蛋白(染色體的組成成分)的甲基化可以改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,影響基因的可及性。當(dāng)組蛋白 H3 的賴氨酸殘基(如 H3K4、H3K9 等)發(fā)生甲基化時(shí),會招募不同的蛋白質(zhì)復(fù)合物,從而***或抑制基因轉(zhuǎn)錄。2、調(diào)節(jié)酶的活性:某些酶的活性可以通過蛋白質(zhì)甲基化來調(diào)節(jié)。甲基化可能改變酶的活性中心的結(jié)構(gòu)或者影響其與底物的結(jié)合能力。

檢測方法:質(zhì)譜分析:這是一種***用于檢測蛋白質(zhì)甲基化的方法。它能夠精確地確定蛋白質(zhì)分子的質(zhì)量,通過比較甲基化和未甲基化蛋白質(zhì)的質(zhì)譜圖,可以鑒定甲基化位點(diǎn)和修飾程度。 貴州二代測序技術(shù)二代測序可以應(yīng)用在哪些方面?

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①二代測序一般多久出結(jié)果?

二代測序(Next-GenerationSequencing,NGS)出結(jié)果的時(shí)間會受到多種因素的影響,一般在數(shù)天到數(shù)周不等。

1、樣本類型和質(zhì)量

不同的樣本類型處理時(shí)間不同。例如,血液樣本相對容易處理,提取DNA的過程比較常規(guī)。如果是組織樣本,可能需要先進(jìn)行樣本的解離等復(fù)雜操作。如果樣本質(zhì)量高,DNA提取和文庫構(gòu)建等前期工作會比較順利,能加快整體進(jìn)程。但如果樣本量少或者DNA有降解等質(zhì)量問題,可能需要重新提取樣本或者進(jìn)行DNA修復(fù)等操作,這會**延長時(shí)間。例如,對于新鮮血液樣本,DNA提取可能在1-2天內(nèi)完成;而對于一些福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)組織樣本,可能需要3-5天來完成高質(zhì)量DNA的提取和后續(xù)的優(yōu)化處理。


二代測序——RNA甲基化的概念、作用和檢測方法

RNA 甲基化概念及位置:RNA 甲基化是在 RNA 分子上添加甲基基團(tuán),其中 N6 - 甲基腺苷(m6A)是最常見的一種 RNA 甲基化修飾形式,它主要發(fā)生在 mRNA(信使 RNA)的腺嘌呤(A)殘基上。

作用

1、影響 RNA 的穩(wěn)定性:m6A 修飾可以影響 mRNA 的穩(wěn)定性。例如,一些帶有 m6A 修飾的 mRNA 更容易被降解,從而調(diào)控基因表達(dá)的時(shí)間和水平。2、調(diào)節(jié) RNA 的剪接和翻譯:m6A 修飾還能夠調(diào)節(jié) mRNA 的剪接過程,影響不同轉(zhuǎn)錄本的生成。同時(shí),它也可以在翻譯水平上發(fā)揮作用,影響蛋白質(zhì)合成的效率。

檢測方法

甲基化 RNA 免疫沉淀測序(MeRIP - Seq):這種方法主要是利用特異性識別 m6A 修飾的抗體,對 RNA 進(jìn)行免疫沉淀富集,然后通過高通量測序來鑒定 m6A 修飾的位點(diǎn)和水平。 二代測序包括全基因組測序和全外顯子測序。

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對于二代測序的概念是什么?

第二代測序(Next-generationsequencing,NGS)又稱為高通量測序(High-throughputsequencing),是基于PCR和基因芯片發(fā)展而來的DNA測序技術(shù)。我們都知道一代測序?yàn)楹铣山K止測序,而二代測序開創(chuàng)性的引入了可逆終止末端,從而實(shí)現(xiàn)邊合成邊測序(SequencingbySynthesis)。二代測序在DNA復(fù)制過程中通過捕捉新添加的堿基所攜帶的特殊標(biāo)記(一般為熒光分子標(biāo)記)來確定DNA的序列,現(xiàn)有的技術(shù)平臺主要包括Roche的454FLX、lllumina的Miseq/Hiseg等。2005年,羅氏推出了二代測序儀羅氏454,生命科學(xué)開始進(jìn)入高通量測序時(shí)代。2006年,隨著Ilumina系列測序平臺的推出,極大降低了二代測序的價(jià)格,推動(dòng)了高通量測序在生命科學(xué)各個(gè)研究領(lǐng)域的普及。 二代測序的工作原理是什么?貴州二代測序技術(shù)

二代測序的優(yōu)勢是低成本。廣東哪里有二代測序檢測

二代測序的建庫步驟②

二、片段化處理

物理方法:超聲破碎是常用的物理片段化方法。它通過超聲波的高頻振動(dòng)將核酸分子打斷成合適大小的片段。例如,在一些文庫構(gòu)建中,將DNA樣本置于超聲破碎儀中,通過調(diào)整超聲功率和時(shí)間,可以將DNA片段化到幾百堿基對(bp)的長度范圍,一般在150-300bp左右,這符合二代測序的讀長要求。超聲破碎的優(yōu)點(diǎn)是片段大小比較均勻,但操作需要優(yōu)化超聲參數(shù),否則可能會導(dǎo)致過度破碎或片段大小不一致。

酶切方法:利用限制性內(nèi)切酶進(jìn)行片段化。限制性內(nèi)切酶能夠識別特定的DNA序列,并在這些序列處切割DNA。例如,用EcoRⅠ酶可以識別GAATTC序列并進(jìn)行切割。通過選擇合適的限制性內(nèi)切酶組合,可以將DNA切割成期望大小的片段。不過,這種方法的局限性在于酶切位點(diǎn)的限制,可能無法獲得理想的片段大小分布,而且可能會引入酶切偏好性。 廣東哪里有二代測序檢測

標(biāo)簽: 二代測序