關(guān)于二代測(cè)序的簡(jiǎn)介:
二代測(cè)序技術(shù)(Next-Generation Seguencing,NGS)也稱為高通量測(cè)序技術(shù),是一種能夠同時(shí)對(duì)數(shù)百萬甚至數(shù)十億個(gè) DNA片段進(jìn)行測(cè)序的方法。與傳統(tǒng)的桑格測(cè)序相比二代測(cè)序技術(shù)具有高通量、高準(zhǔn)確性、高靈敏度和低成本等優(yōu)勢(shì)。
二代測(cè)序技術(shù)在大幅提高了測(cè)序速度的同時(shí),大幅度的降低了測(cè)序成本,保持了高準(zhǔn)確性,以前完成一個(gè)人類基因組的測(cè)序需要3年時(shí)間,而使用二代測(cè)序技術(shù)則需要1周,但其序列讀長(zhǎng)方面比起一代測(cè)序技術(shù)則要短很多,大多只100bp-150bp。
二代測(cè)序的過程有哪些?北京嘉安健達(dá)二代測(cè)序價(jià)格
二代測(cè)序的建庫步驟⑥
六、文庫質(zhì)量檢測(cè)
定量檢測(cè):使用熒光定量PCR(qPCR)或其他核酸定量方法(如Qubit)來確定文庫的濃度。Qubit是一種基于熒光染料與核酸特異性結(jié)合的定量方法,它可以準(zhǔn)確地測(cè)量DNA或RNA的濃度,并且對(duì)不同大小的核酸片段有較好的定量準(zhǔn)確性。通過定量檢測(cè),可以了解文庫的產(chǎn)量,為后續(xù)的測(cè)序上樣量提供參考。
片段大小檢測(cè):利用瓊脂糖凝膠電泳或生物分析儀(如Agilent2100Bioanalyzer)來檢測(cè)文庫片段大小。瓊脂糖凝膠電泳是一種傳統(tǒng)的方法,通過將文庫樣品在瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳,根據(jù)DNA片段在電場(chǎng)中的遷移速度來判斷片段大小。生物分析儀則可以提供更精確的片段大小分布和濃度信息,它是基于微流體芯片技術(shù),能夠快速、準(zhǔn)確地分析文庫質(zhì)量。 內(nèi)蒙古二代測(cè)序技術(shù)二代測(cè)序廣泛應(yīng)用于個(gè)性化醫(yī)學(xué)。
二代測(cè)序技術(shù)的一些***研究進(jìn)展①
疾病診斷與***領(lǐng)域 :消化系統(tǒng)**標(biāo)志物檢測(cè):2024 年的**共識(shí)指出,二代測(cè)序(NGS)技術(shù)可同時(shí)檢測(cè)消化系統(tǒng)**中的多種標(biāo)志物,如錯(cuò)配修復(fù)基因變異、微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)狀態(tài)、**突變負(fù)荷(TMB)等,為**的精細(xì)***提供了更***、準(zhǔn)確的信息。例如,MSI-H 的實(shí)體瘤患者可使用帕博利珠單抗進(jìn)行***,而 NGS 技術(shù)能更好地檢測(cè) MSI 狀態(tài)及相關(guān)耐藥機(jī)制。
**液體活檢:通過檢測(cè)血液中的循環(huán)** DNA(ctDNA)等標(biāo)志物,實(shí)現(xiàn)對(duì)**的早期篩查、診斷和***監(jiān)測(cè)。NGS 技術(shù)能夠更敏感地檢測(cè)到 ctDNA 中的基因突變和變異,為**的無創(chuàng)診斷提供了有力支持。
什么樣本可以做二代測(cè)序?③
細(xì)胞樣本
培養(yǎng)細(xì)胞:包括各種原代培養(yǎng)細(xì)胞和細(xì)胞系。在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究中,對(duì)培養(yǎng)的細(xì)胞進(jìn)行測(cè)序可以了解細(xì)胞的基因特征和功能變化。例如,在研究細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路時(shí),對(duì)經(jīng)過特定刺激處理的培養(yǎng)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,以分析基因表達(dá)的上調(diào)或下調(diào)情況。
脫落細(xì)胞:如痰液中的脫落細(xì)胞、尿液中的脫落細(xì)胞等。這些細(xì)胞可以用于某些疾病的篩查。例如,在肺*篩查中,對(duì)痰液中的脫落細(xì)胞進(jìn)行基因檢測(cè),通過二代測(cè)序?qū)ふ曳?相關(guān)的基因突變,作為一種非侵入性的檢測(cè)方法。 denovo測(cè)序是二代測(cè)序嗎?
二代測(cè)序——轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的應(yīng)用領(lǐng)域
1、基礎(chǔ)生物學(xué)研究:可以用于研究生物的發(fā)育過程。例如,在胚胎發(fā)育過程中,通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可以了解不同階段胚胎細(xì)胞中基因的表達(dá)變化,揭示胚胎發(fā)育的分子機(jī)制。還可以用于物種進(jìn)化研究,比較不同物種間轉(zhuǎn)錄組的差異,推斷基因表達(dá)的進(jìn)化模式。
2、醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷:在疾病研究方面,用于尋找疾病相關(guān)的生物標(biāo)志物。例如,在**研究中,通過對(duì)比**組織和正常組織的轉(zhuǎn)錄組,可以發(fā)現(xiàn)一些在**中特異性高表達(dá)或低表達(dá)的基因,這些基因有望成為**診斷、預(yù)后判斷的標(biāo)志物。同時(shí),也可以用于藥物研發(fā),通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序了解藥物作用后細(xì)胞基因表達(dá)的變化,評(píng)估藥物療效和毒性。
3、農(nóng)業(yè)和植物學(xué)研究:在作物育種中,可以研究不同品種作物在抗逆性(如抗旱、抗寒、抗?。┑确矫娴幕虮磉_(dá)差異,為培育優(yōu)良品種提供理論依據(jù)。在植物生長(zhǎng)發(fā)育研究中,分析植物在不同生長(zhǎng)環(huán)境和生長(zhǎng)階段的轉(zhuǎn)錄組變化,了解植物***等因素對(duì)植物生長(zhǎng)的調(diào)控機(jī)制。 二代測(cè)序可以檢測(cè)基因嗎?江蘇嘉安健達(dá)二代測(cè)序價(jià)格
二代測(cè)序結(jié)果怎么分析?北京嘉安健達(dá)二代測(cè)序價(jià)格
二代測(cè)序技術(shù)在不同人群中的準(zhǔn)確性有何差異①
**患者
優(yōu)勢(shì):對(duì)于**患者,二代測(cè)序技術(shù)準(zhǔn)確性相對(duì)較高,在**的診斷、***及監(jiān)測(cè)等方面應(yīng)用***。比如肺*患者,通過檢測(cè)**組織或血液中的基因突變,可準(zhǔn)確找到如EGFR、ALK等驅(qū)動(dòng)基因突變,為靶向***提供依據(jù),其準(zhǔn)確率通常在90%以上。在軟組織**中,二代測(cè)序能檢測(cè)到**組織的基因信息,包括突變基因、基因表達(dá)情況等,幫助醫(yī)生更準(zhǔn)確地診斷病情,并制定個(gè)性化的***方案。
局限性:腫瘤細(xì)胞的異質(zhì)性會(huì)影響檢測(cè)準(zhǔn)確性,若樣本中腫瘤細(xì)胞比例低或存在多種類型細(xì)胞,可能導(dǎo)致部分基因突變漏檢,影響對(duì)**基因組全貌的評(píng)估。此外,血液樣本中循環(huán)**DNA含量低且釋放不穩(wěn)定,也會(huì)使檢測(cè)結(jié)果存在波動(dòng),影響準(zhǔn)確性 北京嘉安健達(dá)二代測(cè)序價(jià)格
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