廣西二代測(cè)序應(yīng)用

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-12-13

二代測(cè)序的建庫(kù)步驟③

三、末端修復(fù)和加A尾(以DNA文庫(kù)為例)

末端修復(fù):經(jīng)過(guò)片段化后的DNA末端可能是不平齊的,有5'-突出端或3'-突出端。末端修復(fù)反應(yīng)可以利用T4DNA聚合酶、Klenow片段等酶,將這些末端補(bǔ)平,使其成為平末端。T4DNA聚合酶具有5'→3'聚合酶活性和3'→5'外切酶活性,在合適的反應(yīng)緩沖液和dNTP(脫氧核糖核苷三磷酸)存在下,可以將突出的末端補(bǔ)平。

加A尾:在末端修復(fù)后的平末端DNA分子的3'-末端加上一個(gè)A堿基。這一步是為了后續(xù)連接帶有T-突出端的接頭做準(zhǔn)備,一般使用Klenow片段(3'→5'外切酶活性缺失)在dATP存在下進(jìn)行加A反應(yīng),這樣可以使DNA片段能夠高效地與帶有T-突出端的測(cè)序接頭連接。 二代測(cè)序可以應(yīng)用在哪些方面?廣西二代測(cè)序應(yīng)用

廣西二代測(cè)序應(yīng)用,二代測(cè)序

二代測(cè)序技術(shù)在不同人群中的準(zhǔn)確性有何差異②

遺傳病患者及攜帶者

優(yōu)勢(shì):在常見(jiàn)單基因遺傳病如囊性纖維化、鐮狀細(xì)胞貧血等的檢測(cè)中,二代測(cè)序技術(shù)準(zhǔn)確性高,能夠快速、準(zhǔn)確地找到致病基因,對(duì)于有家族遺傳病史的人群,可有效確定是否攜帶致病基因,評(píng)估生育患病后代的風(fēng)險(xiǎn)。

局限性:對(duì)于罕見(jiàn)遺傳病,由于基因突變的多樣性和復(fù)雜性,可能存在部分致病基因未被覆蓋或難以準(zhǔn)確解讀的情況,導(dǎo)致準(zhǔn)確性有所降低。此外,即使檢測(cè)結(jié)果為陰性,也不能完全排除患病可能,因部分遺傳病可能由未知基因突變或基因與環(huán)境相互作用引起2 貴州哪里有二代測(cè)序技術(shù)基因組重測(cè)序是二代測(cè)序嗎?

廣西二代測(cè)序應(yīng)用,二代測(cè)序

二代測(cè)序的應(yīng)用領(lǐng)域有哪些?

基因組學(xué)研究:用于全基因組測(cè)序,快速獲取物種的基因組序列信息,研究基因組結(jié)構(gòu)、變異、進(jìn)化等;進(jìn)行全外顯子組測(cè)序,重點(diǎn)關(guān)注編碼蛋白質(zhì)的外顯子區(qū)域,發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)的基因突變。

轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究:通過(guò)對(duì)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測(cè)序,可分析基因的表達(dá)水平、可變剪接、新轉(zhuǎn)錄本發(fā)現(xiàn)等,有助于深入了解基因在不同生理和病理狀態(tài)下的表達(dá)調(diào)控機(jī)制。

疾病診斷與***:在遺傳病診斷中,能夠檢測(cè)出導(dǎo)致遺傳病的基因突變,為疾病的診斷、遺傳咨詢(xún)和產(chǎn)前診斷提供依據(jù);在**研究中,可分析腫瘤細(xì)胞的基因突變、拷貝數(shù)變異、基因融合等,為**的早期診斷、靶向***和預(yù)后評(píng)估提供支持。

藥物研發(fā):用于藥物靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)和驗(yàn)證,通過(guò)分析疾病相關(guān)的基因變異和表達(dá)變化,確定潛在的藥物作用靶點(diǎn);還可進(jìn)行藥物基因組學(xué)研究,預(yù)測(cè)患者對(duì)藥物的反應(yīng)和不良反應(yīng),實(shí)現(xiàn)個(gè)體化藥物***。

微生物學(xué)研究:對(duì)微生物群落進(jìn)行宏基因組測(cè)序,無(wú)需培養(yǎng)即可分析微生物的種類(lèi)、豐度和功能基因,了解微生物群落的結(jié)構(gòu)和動(dòng)態(tài)變化,研究微生物與宿主的相互作用,以及在環(huán)境科學(xué)、農(nóng)業(yè)、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域的應(yīng)用


二代測(cè)序技術(shù)的一些***研究進(jìn)展③

技術(shù)優(yōu)化與創(chuàng)新領(lǐng)域

測(cè)序準(zhǔn)確性提高:通過(guò)改進(jìn)測(cè)序試劑、優(yōu)化測(cè)序反應(yīng)條件以及開(kāi)發(fā)更先進(jìn)的數(shù)據(jù)分析算法,二代測(cè)序技術(shù)的準(zhǔn)確性不斷提升,能夠更可靠地檢測(cè)到低頻變異和復(fù)雜結(jié)構(gòu)變異等。

成本進(jìn)一步降低:隨著技術(shù)的不斷成熟和市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)的加劇,二代測(cè)序的成本持續(xù)下降,使得更多的研究機(jī)構(gòu)和臨床實(shí)驗(yàn)室能夠廣泛應(yīng)用該技術(shù),推動(dòng)了基因組學(xué)研究和臨床診斷的發(fā)展。

法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域

遺傳標(biāo)記檢測(cè):現(xiàn)有的二代測(cè)序技術(shù)平臺(tái)能夠完成 STR 遺傳標(biāo)記、SNP 遺傳標(biāo)記、mtDNA 及 mRNA 等遺傳標(biāo)記的測(cè)序,為法醫(yī)學(xué)個(gè)體識(shí)別、親緣關(guān)系鑒定等提供了更豐富、準(zhǔn)確的遺傳信息。

技術(shù)應(yīng)用挑戰(zhàn)與應(yīng)對(duì):測(cè)序試劑盒中部分遺傳標(biāo)記的優(yōu)化、針對(duì)中國(guó)人群測(cè)序需求的試劑盒開(kāi)發(fā)、數(shù)據(jù)采信標(biāo)準(zhǔn)的制定、測(cè)序數(shù)據(jù)分析軟件的優(yōu)化以及與現(xiàn)有法醫(yī)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的對(duì)接等,是二代測(cè)序技術(shù)在法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域廣泛應(yīng)用的關(guān)鍵,相關(guān)研究正在不斷推進(jìn)以解決這些問(wèn)題 。 二代測(cè)序?qū)嶒?yàn)與測(cè)序原理是什么?

廣西二代測(cè)序應(yīng)用,二代測(cè)序

②二代測(cè)序一般多久出結(jié)果?

2、測(cè)序平臺(tái)和通量

不同的二代測(cè)序平臺(tái)有不同的通量(一次能測(cè)序的樣本數(shù)量和數(shù)據(jù)量)和測(cè)序速度。一些高通量的測(cè)序平臺(tái),如IlluminaNovaSeq系列,能夠在較短時(shí)間內(nèi)產(chǎn)生大量的數(shù)據(jù)。但如果使用的是通量較低的小型測(cè)序儀,或者測(cè)序儀的運(yùn)行時(shí)間被多個(gè)項(xiàng)目分配,都會(huì)影響結(jié)果產(chǎn)出的時(shí)間。例如,在高通量平臺(tái)上進(jìn)行全基因組測(cè)序,測(cè)序運(yùn)行時(shí)間可能在2-7天左右,具體取決于測(cè)序深度等因素。而對(duì)于一些小型臺(tái)式測(cè)序儀進(jìn)行靶向基因測(cè)序,運(yùn)行時(shí)間可能在1-3天。 擴(kuò)增子測(cè)序是二代測(cè)序嗎?重慶哪里有二代測(cè)序應(yīng)用

二代測(cè)序與Sanger測(cè)序相同嗎?廣西二代測(cè)序應(yīng)用

二代測(cè)序—全外顯子測(cè)序的優(yōu)勢(shì)

針對(duì)性強(qiáng):它主要聚焦于基因組中編碼蛋白質(zhì)的區(qū)域,這部分區(qū)域雖然只占整個(gè)基因組的 1 - 2% 左右,但包含了大部分與疾病相關(guān)的突變。例如,在研究孟德?tīng)栠z傳病時(shí),很多致病突變都位于外顯子區(qū)域,通過(guò)全外顯子測(cè)序可以更高效地找到這些突變。

成本效益高:相比于全基因組測(cè)序,全外顯子測(cè)序的成本相對(duì)較低。因?yàn)樗恍枰獙?duì)整個(gè)基因組(包括大量的非編碼區(qū)域)進(jìn)行測(cè)序,在一定程度上減少了數(shù)據(jù)量和測(cè)序成本,同時(shí)又能獲取大部分有重要功能意義的遺傳信息。 廣西二代測(cè)序應(yīng)用

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