我國工廠養(yǎng)殖目前受水處理成本的壓力，仍主要以流水養(yǎng)殖、半封閉循環(huán)水養(yǎng)殖為主，真正意義上的全封閉循環(huán)水養(yǎng)殖企業(yè)較少。流水養(yǎng)殖和半封閉養(yǎng)殖方式產量低（單位水體產量10—15千克/米2·年）、耗能大、效率低，與先進國家技術密集型的循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)相比，在系統(tǒng)的循環(huán)水率、系統(tǒng)輔助水體的比率等關鍵性能方面基本接近國際水平，在設備、工藝、產量（先進技術的產量達100千克/米2·年以上）和效益等方面，以及生物凈化系統(tǒng)的構建、凈化效率和穩(wěn)定性、系統(tǒng)集成度、系統(tǒng)穩(wěn)定性等方面仍存在著一定的差距。
工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖的實質是養(yǎng)殖生產的工業(yè)化，生產過程可控，可以跨季節(jié)養(yǎng)殖，產品像工業(yè)品一樣可以有計劃地均衡上市。其特點：一是用水量少，可利用較低質水源，對水資源要求較低；二是占地少，對土地資源的要求低；三是養(yǎng)殖密度高，單位耗水產量大；四是易于控制生長環(huán)境，魚類(以及其他養(yǎng)殖種類)生長速度快，生長周期短；五是飼料利用率高；六是水循環(huán)使用，利用系數(shù)高；七是排放的廢水廢物少，能集中處理，對環(huán)境無壓力或很小；八是不受外界氣候的影響，可實現(xiàn)常年生產。
在目前的發(fā)展水平下，循環(huán)水養(yǎng)殖模式較高的準入門檻使得循環(huán)水養(yǎng)殖與普通低附加值魚類無緣，而名貴海水魚類可養(yǎng)殖品種有限，限制了循環(huán)水養(yǎng)殖模式的發(fā)展。近些年來，經過專家學者和眾多的養(yǎng)殖企業(yè)的不斷探索，國內循環(huán)水養(yǎng)殖品種的豐富度大大提高，如：斑石鯛、墨瑞鱈魚、黃條鰤等。循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)既是一個復雜的系統(tǒng)工程，又是一個矛盾的綜合體，因此，不可能存在一種十全十美、適用于所有養(yǎng)殖品種的循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)，只要不出現(xiàn)明顯的設計漏洞，系統(tǒng)運行過程中遇到的很多問題，可以通過系統(tǒng)管理技術和養(yǎng)殖技術來解決。