但目前來看，工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖技術(shù)和系統(tǒng)的推廣還存在以下問題：是基礎建設成本高，投入大?，F(xiàn)在采用循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的企業(yè)大多數(shù)為具有一定規(guī)模，技術(shù)力量和實力較為雄厚的養(yǎng)殖企業(yè)，而對大部分小本經(jīng)營的養(yǎng)殖戶（單位）來說是可望而不可即，這也使循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)和技術(shù)的大范圍推廣受到了制約。部分工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)由于設計存在問題或其他一些人為原因，運行不充分或運行效率較低，影響了工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖的總體水平，節(jié)水節(jié)能技術(shù)路線有待進一步探討、完善。
主要目的是存水，以期在枯水期能有足夠的水源進行養(yǎng)殖而已。這種方式?jīng)]有考慮水體的循環(huán)利用，而純粹出于延長養(yǎng)殖周期。在此基礎上，有部分養(yǎng)殖場為了提高生產(chǎn)效率和應對自然條件限制從而開始了半循環(huán)養(yǎng)殖方式。生物絮團是養(yǎng)殖水體中以好氧微生物為主體的有機體和無機物，經(jīng)生物絮凝形成的團聚物，由細菌、浮游動植物、有機碎屑和一些無機物質(zhì)相互絮凝組成。
工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中溶解氧是非常重要的，溶解氧是養(yǎng)殖動物氧氣需求的來源，是養(yǎng)殖動物生存及正常生理活動的根本保證。溶解氧可以氧化殘留有機質(zhì)跟水體及池底的有害物質(zhì)，有利于耗氧性微生物生長繁殖，促進有機物降解，減少有毒、有害物質(zhì)的作用，抑制厭氧微生物的活動?？偠灾芙庋鯇τ谒a(chǎn)養(yǎng)殖，是一個重要的因素之一。在養(yǎng)殖中，偶爾會存在溶解氧不足的情況，溶氧不夠無法提高產(chǎn)量甚至會影響水質(zhì)，這時我們就必須為養(yǎng)殖水里增氧。增氧的方式有很多種，常見的有羅茨風機、高壓風機、液氧罐、制氧機等等。